医药学院成立于2015年，是以中医学、中药学专业为核心和特色的医药卫生类专业学院。学院聚焦中医药传承与现代化健康服务领域，着力培养“大医精诚、乐于奉献”的职业精神，使学生成为“专业基础实、临床技能熟、学习能力强、职业素养高”的大健康领域所需要的应用型人才。

学院设有中医学专业、中药学专业（省级一流专业）、护理学专业、康复治疗学专业、口腔医学专业、眼视光学专业和基础医学部；设有中医药实训（验）中心、口腔医学实训中心、基础医学实验中心、护理实训中心、康复实训中心、视光实训中心6个实训中心。拥有直属附属医院1所、实习单位41家。

学院现有教师292人，其中专任教师218人，专任教师中博士、硕士研究生学历占87.6%（博士30人、硕士161人），副高级及以上职称教师80人占36.7%。拥有教育部药品类职业教育教学指导委员会委员1人、“吉林好人·最美教师暨黄大年式好老师”最美团队1个、吉林省优秀教师1人、吉林省特约教育督导员1人、吉林省技术能手3人、吉林省首届教育世家称号1人、吉林省高层次D类和E类人才6人、国务院特殊津贴获得者1人；长春市政府督学1人、吉林市医学会口腔分会副主任委员1人；校级教学名师2人、教学新秀1人、师德标兵4人、最美教师2人、师德先进个人1人、优秀专业主任1人。

学院建有吉林省特色高水平专业（群）（中医药养老养生专业群），获吉林省高校服务“一主六双”高质量发展优秀案例；拥有省级课程思政示范课程2门、省级优秀课1门、校级一流课程1门；获吉林省高校课程思政优秀案例1项。

学院教师获吉林省首届黄炎培职业教育“杰出教师奖”1人、吉林省高校思想政治理论课“精彩一课”教学比赛二等奖1项、吉林省微课比赛二、三等奖4项、吉林省本科高校智慧课堂教学创新大赛三等奖1项、吉林省高校教师教学创新大赛三等奖3项、吉林省第三届高校青年教师教学竞赛三等奖1项、第二届“泛雅杯”全国高校智慧课程设计大赛国家级优秀奖1项。

学院建设了“中医药产业学院”“省级虚拟仿真实验室”，获批“第二批全国学校急救教育试点”；学院聚焦医药健康研究领域，以长白山特色资源的深度开发为创新源头，建成吉林双阳鹿茸科技小院等平台，服务于区域经济高质量发展、乡村振兴战略和大健康产业。近三年，承担国自然面上、青年等国家级课题6项，承担吉林省自然科学基金，吉林省发改委建设项目、吉林省教育厅科学研究等省级科研课题20余项，在Science、iMeta、PNAS等国内外杂志上发表论文70余篇，授权发明专利10余项，获吉林省自然科学二等奖1项。研究成果入选 “2024中国农业科学重大进展”，先后被国际著名科普杂志《The Scientist》和《New Scientist》报道。

学院现有学生4445人（2026年8月统计）。近三年，学生获得“挑战杯”吉林省大学生竞赛国家铜奖1项、省级一等奖3项、省级二等奖5项，省级三等奖2项、校级三等奖5项；“挑战杯”大学生竞赛校级三等奖1项；全国大学生生命科学竞赛（科学探究类）国家级三等奖1项、省级二等奖1项、省级三等奖1项；医学创新大赛省级三等奖2项、优秀奖2项；全国大学生普通话大赛校级三等奖1项；吉林省大学生职业规划大赛省级二等奖1项、省级三等奖1项、校级三等奖2项、校级优秀奖10项；中国国际大学生创新大赛国家级铜奖1项、省级银奖1项、省级铜奖1项、校级金奖1项、校级铜奖3项；吉林省职业技能大赛省级银奖1项、铜奖1项；吉林省冰雪创意大赛三等奖3项；全国高校商业精英挑战赛品牌策划赛国家二等奖1项、三等奖3项；长春科技学院2024年“五育融合，健康同行”心理情景剧活动校级三等奖1项。专业就业竞争力强，近三年学生毕业去向落实率逐年升高，2026年毕业去向落实率达到90.23%，社会满意度较高，深受用人单位的欢迎。