医药学院承担多项国家、省市及其他各类科研项目，其中包括中科院A类先导专项（720万元）、国自然重点项目（联合基金，350万）、国自然面上项目（50万元）、国自然青年项目2项（60万元），吉林省自然科学基金重点项目（100万元）、863和973子课题（约500万元）、吉林省自然科学基金－联合基金项目（90万元），合计科研经费达2000万元。

近年来，学院科研硕果累累。先后获得国家科技进步二等奖1项、吉林省科技进步二等奖3项，吉林省自然科学一等奖1项和吉林省自然科学二等奖1项，以及其他多个科研奖项；发表重点期刊学术论文300余篇，其中SCI收录文章160余篇；获得国家发明专利30余项，制定地方标准2项；出版专著9部。

在教科研方面，荣获第十四届“挑战杯”中国大学生创业竞赛“国赛铜奖”，是我校在“挑战杯”赛事上的历史新突破；第二届“乡村振兴”职业技能大赛省级一等奖；吉林省青年创新创业大赛三等奖1项、优秀奖1项。